تعیین توالی بخش hvr1 از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد مغانی

پایان نامه
چکیده

گوسفند به عنوان حیوانی اهلی برای قرن ها نقش مهمی در تامین منابع غذایی مردمان سرزمین فلات ایران بر عهده داشته است و این ناحیه به عنوان منشا این گونه به شمار می رود. در بین نشانگر های ژنتیکی، توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روشها برای طبقه بندی ژنتیکی جمعیت ها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه hvr1 از ژنوم میتوکندری یکی از نژاد های گوسفند بومی ایران (گوسفند مغانی) می باشد. برای انجام این تحقیق تعداد 10 عدد نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوندجمع آوری شد. پس از استخراج dna از آنها، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک pcr تکثیر شده و بعد از بدست آمدن بهترین جواب در pcr، تعیین توالی شد. پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی hvr1 از ژنوم گوسفند مغانی با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژاد ها از مناطق مختلف جهان، مشخص شد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی a می باشد، از مقایسه توالی ناحیهhvr1 گوسفند مغانی با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی a از ژنوم گوسفندان سایر نژاد، نزدیکی آن با نژاد بلوچی ایران و یک نژاد از ترکیه تعیین شد که به دلیل مکان زیستی این نژاد از نظر جغرافیایی دور از انتطار نبود همچنین تجزیه و تحلیل نمودار فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی a نشان داد حتمالاً قوچ و میش اوریال به عنوان منشا نژاد بلوچی و نزادهای آسیایی مورد مطالعه مطرح است و این نژادها از آن مشتق شده اند. در نهایت توالی به دست آمده از این منطقه برای اولین بار در بانک ژن با کد دسترسی fj531545 ثبت و نام گوسفند مغانی برای اولین بار در بانک جهانی ژن آورده شد و این نژاد به انجمن های بین المللی معرفی شد.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری در شش نژاد گوسفند ایرانی

سابقه و هدف: به دلیل تعداد افراد کم در جمعیت‌های گوسفند بومی موجود در نقاط مختلف ایران، حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت‌ها برای انجام برنامه‌های اصلاح نژادی بسیار مهم است. همچنین این نکته را باید متذکر شد که نژادهای گوسفند بومی به عنوان سرمایه ملی کشور محسوب می‌شوند و حفظ تنوع ژنتیکی آن‌ها بسیار ضروری می‌باشد. بررسی ژنوم میتوکندری شاخصی مناسب برای نشان دادن میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت‌های مختلف دامی ا...

متن کامل

تجزیه فیلوژنتیک و هاپلوگروهی بزهای بومی ایران بر اساس توالی نوکلئوتیدی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری

بزهای بومی ایران به­عنوان یکی از ذخایر ژنتیکی ارزشمند محسوب می­شوند و حفظ تنوع ژنتیکی آنها حائز اهمیت است. ژنوم میتوکندری در یک اکوتیپ و مقایسه آن با سایر اکوتیپ­ها می­تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در آن جمعیت را ارائه دهد. هدف از پژوهش اخیر بررسی ساختار ژنتیکی و ترسیم روابط فیلوژنتیکی ناحیه HVR1 میتوکندری چهار توده جمعیتی بز­های بومی ایران شامل سیستانی، پاکستانی، عدنی و سیاه لری (هر کد...

متن کامل

مطالعة ساختار ژنتیکی اسب‌های بومی ایران با استفاده از توالی D-loop ژنوم میتوکندری

در این مطالعه، به منظور آگاهی از ساختار ژنتیکی اسب‌های بومی ایران در مقایسه با نمونه‌های خارجی، نمونه‌های خون از 95 رأس اسب از جمعیت‌های متعدد نقاط مختلف کشور و 114 توالی D-loop میتوکندری از بانک اطلاعات ژنوم بدست آمد. DNA کلیة نمونه‌های بومی با استفاده از روش شستشوی نمکی استخراج شده و بعنوان الگو برای تکثیر و تعیین توالی ناحیة D-loop ژنوم میتوکندری بکار برده شدند. با آنالیز توالی قطعة 247 جفت ...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان بومی فارس بر مبنای توالی‌یابی بخشی از ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری

Native chickens are considered as national genetic resources and their conservation is very important from biodiversity aspects. The study of mitochondrial genome in one breed and comparing it with others can be a useful index for genetic diversity in that population. This study carried out for determining the sequences of mitochondrial high variable 1 (HVR-I) of D-loop region in Fars native c...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی لاک پشت دریایی منقار عقابی (Eretmochelys imbricata) موجود در دو جزیره کیش و قشم با استفاده از تعیین توالی ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری

به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت لاک پشت منقار عقابی (Eretmochelys imbricata) در دو جزیره خلیج فارس با استفاده از تعیین توالی ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری، 40عدد جنین مرده لاک پشت از دو جزیره قشم و کیش جمع آوری گردید. حدود bp890 از ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری تکثیر و تعیین توالی شد. در این مطالعه 5 محل (مکان) پلی مورف و 6 ه...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023